新四军江南指挥部纪念馆是以旧址为依托的综合性纪念场所。经扩建后，现纪念馆景区占地60余亩，分为旧址区和新馆区。 1938年夏，新四军第1、第2支队相继挺进苏南敌后，创建抗日游击根据地。次年8月，新四军军部决定，并报中共中央、中央军委批准，成立新四军江南指挥部，统一领导第1、第2支队和地方抗日武装。1939年11月7日，新四军江南指挥部在溧阳水西村公开宣布成立，指挥陈毅，副指挥粟裕。出于不扰民的原则，将司令部设在水西村李氏宗祠（又名光裕堂，始建于明代万历年间），自此陈毅、粟裕等同志在水西村运筹帷幄、决战千里，并从苏南抗日斗争的实际出发，创造性地运用“武装斗争、统一战线和党的建设”三大法宝，创建、巩固和发展了以茅山为中心的苏南抗日根据地。到1940年春，新四军第1、第2支队由初入苏南时的4000余人发展到14000余人，从水西村走出去的少将军衔以上的有88位，人民解放军第20、第23、第24集团军便是江南指挥部所属部队发展壮大起来的。由此，新四军江南指挥部的成立，是中国人民革命斗争中的一件大事，在我党党史、我军军史上占有重要的一页。

为了深切缅怀陈毅、粟裕等老一辈无产阶级革命家的丰功伟绩，教育后代，继承和发扬新四军的革命精神，从1979年起，溧阳市对尚存的新四军江南指挥部旧址进行修复，并经江苏省政府批准，建立了新四军江南指挥部陈列馆（1989年改为现馆名）。1984年11月，值新四军江南指挥部成立45周年之际，陈列馆正式对外开放。自开放以来，纪念馆接待观众800万人次，叶飞、姬鹏飞、彭冲、迟浩田、张震等党和国家领导人也相继重返故地参观视察。

新四军江南指挥部纪念馆先后被命名为“江苏省学校德育教育基地”、“江苏省全民国防教育基地”和“江苏省爱国主义教育基地”和国家2A级旅游景区。2007年，被江苏省全民国防防教育委员会授予“全民国防教育先进单位”的光荣称号。